脳神経外科疾患は多岐にわたるため手術も一様ではありません。
【脳腫瘍】脳・神経機能をモニタリングしつつ、開頭もしくは内視鏡により摘出術を行います。中には緊急手術を要するものもありますが、多くは詳細な検査後に行います。
【神経減圧術】三叉神経痛や顔面痙攣に対し、脳神経モニタリング下に神経を圧迫している血管を移動させ、圧迫を解除します。症例によっては、内視鏡も用いて安全かつ低侵襲に行うよう取り組んでいます。
【くも膜下出血】緊急手術の適応となることが大半です。出血原因の破裂脳動脈瘤に開頭クリッピング術やカテーテルによるコイル塞栓術を行います。
【脳出血】開頭血腫除去術を行うこともありますが、内視鏡を用いた低侵襲性手術を多く行っています。また、出血原因の血管奇形などがある場合はこれも摘出します。
【脳梗塞・もやもや病】脳梗塞予防目的に、内頚動脈狭窄部の内膜剥離術を行ったり、頭皮の動脈を頭蓋内動脈に吻合する手術を行います。
【血管内手術】脳血管内へカテーテルを導入し、ここから塞栓物を挿入し病変部を塞栓することで治療を行います。対象疾患は脳動脈瘤、脳動静脈奇形、血管性腫瘍などです。
【血栓回収術】脳梗塞発症超急性期に、症状を改善するため、カテーテルを用いて血栓を回収し、閉塞した脳血管を再開通させます。
【神経内視鏡手術】水頭症の治療をシャントを用いず内視鏡的に低侵襲で行うことができます。また脳腫瘍の生検・摘出を行うこともできます。
【先天奇形】脳室内髄液を腹腔内へ短絡させるシャント手術などを行います。

脳腫瘍術後補助療法として放射線治療は効果的であり、当科では放射線治療部の協力の下、放射線療法が適応となる病態全てに対応しています。神経膠腫に対する通常局所照射は約１ヶ月半、転移性脳腫瘍、中枢神経系原発悪性リンパ腫に対する全脳照射は通常２週間から４週間程度を要します。1998年から医療保険診療に採用された直線加速器（LINAC)による定位放射線照射（１回照射又は少数分割照射）の治療経験も症例を蓄積しています。転移性脳腫瘍、聴神経鞘腫を中心に髄膜腫、下垂体腺腫、頭蓋咽頭腫、脳動静脈奇形等に対し、低侵撃、低リスクに高い治療効果を得ていますが、治療適応、治療効果、治療リスクは病態、患者さん個々により異なりますのでご相談ください。実際には、２泊３日の入院を原則に、症例に応じて対応しております。月曜日午前又は第１、第３土曜日午前の定位放射線治療外来にご相談ください。

脳腫瘍に対し手術の補助療法として抗癌剤を用いた化学療法を行う場合があります。内容は疾患により様々です。